Forschungsunternehmen im Bereich Präzisionsmedizin steigert die Effizienz beim Umstieg auf die Cloud

Die Herausforderungen von PierianDx und sein Weg in die Cloud

PierianDx ermöglicht es klinischen Labors, personalisierte Medizinprogramme zu starten oder zu beschleunigen, indem zwei große Herausforderungen angegangen wurden, die sich aus der zunehmenden Verwendung von Sequenztests der nächsten Generation (NGS) ergaben: Skalierbarkeit und Handhabung der Komplexität größerer Gensätze. Mit PierianDx können klinische Labors Arbeitsabläufe optimieren und auf einen einzigen, integrierten Bereich zugreifen, der eine kuratierte Wissensdatenbank, umfassende Analysen, aufschlussreiche Interpretationen und präzise Berichte bietet.

Diese „One Space“-Lösung ist der Clinical Genomicist Workspace (CGW) von PierianDx. Diese vollständige Suite von Lösungsmodulen wird von Support-Services begleitet, die ein datenbasiertes Ökosystem für klinische Labors bieten, um ihre NGS-Testprogramme zu starten oder zu erweitern. Die Lösung von PierianDx wurde von einem Team aus Genomikern, Pathologen, Klinikern und Softwareentwicklern entwickelt und verwaltet und wird heute von führenden akademischen medizinischen Zentren, Gesundheitssystemen, Krebszentren, Kinderkrankenhäusern und kommerziellen Labors weltweit eingesetzt.

PierianDx wollte Cloud-Computing als Möglichkeit nutzen, große Datasets aus den NGS-Tests seiner Kunden und der Nutzung von CGW kostengünstig zu speichern. Jede Sequenz eines menschlichen Genoms kann 100 GB oder mehr Speicherplatz in Anspruch nehmen. Daher benötigte PierianDx eine skalierbare Lösung, die Terabyte von Rohgenomdaten speichern konnte. Darüber hinaus stellt die sinnvolle und kostengünstige Verarbeitung von Genomdaten in großem Umfang an sich einen Big-Data-Speicherungs- und -Analyse-Workload dar.

PierianDx musste Computing-Ressourcen in einer Massively Parallel Processing (MPP)-Architektur skalieren, um die Lieferung von Ergebnissen zu beschleunigen. Das Unternehmen wollte jedoch nur für tatsächlich genutzte Ressourcen und nur bei Nutzung bezahlen. Darüber hinaus musste sich die Lösung in einer Umgebung befinden, die aufgrund der Sensibilität menschlicher Genomdaten die HIPAA-Compliance-Anforderungen erfüllt.

Lösung für PierianDx

Nach Durchführung von Marktforschung und Due Diligence entschied sich PierianDx für Amazon Web Services als Cloud-Computing-Plattform. PierianDx entschied sich auch für Hitachi Vantara, einen AWS Premier Consulting Partner, um die Plattform auf AWS zu erstellen, die Lösung täglich zu verwalten und die HIPAA-Compliance ununterbrochen aufrechtzuerhalten.

PierianDx entschied sich für Amazon Web Services wegen ihrer umfassenden Plattform von Webservices, um die IT-Infrastruktur weltweit in einem Self-Service-Modell bereitzustellen. AWS bot PierianDx eine Möglichkeit, Big-Data-Verarbeitungscluster auf Amazon EC2 zu skalieren und gleichzeitig die Arbeitsabläufe für die Genomverarbeitung zu automatisieren.

Globus Genomics, Marktführer im Bereich Bioinformatik und Genomverarbeitung, verwies PierianDx an Hitchi Vantara. Dieses Unternehmen und Globus Genomics hatten bereits für eine HIPAA-konforme Pipeline auf AWS Test Drive zusammengearbeitet und gemeinsam eine Lösung für Genomverarbeitung entwickelt. PierianDx hat sich für das Unternehmen aufgrund seines umfassenden Fachwissens in den Bereichen Sicherheit, Compliance und Amazon Web Services entschieden. Darüber hinaus bot das Unternehmen PierianDx einen umfassenden Service mit Entwicklung einer Hybridarchitektur, Migration der Lösung in die AWS-Cloud und täglicher Verwaltung der gesamten Umgebung, während gleichzeitig die HIPAA-Compliance-Anforderungen mit Managed Services kontinuierlich erfüllt wurden. End-to-End-Beratung und Managed Services machten das Cloud-Services-Team von Hitachi Vantara zum Beratungs- und Betriebspartner der Wahl.

Die Vorteile der Cloud

PierianDx war in der Lage, eine innovative Verarbeitungsplattform und -lösung für die Genomsequenzierung aufzubauen, die das Fachwissen seiner klinischen und biomedizinischen Forschungsexperten voll ausschöpft. Die Lösung belastet das Unternehmen nicht mit einer undifferenzierten größeren Umstellung von IT-Infrastruktur und -Management. Die leistungsstarke Kombination aus AWS und einem AWS Consulting Partner, d. h. Hitachi Vantara, zur Bereitstellung von Infrastruktur, Sicherheit und Compliance ermöglicht es PierianDx, sich auf seine Kernkompetenzen zu konzentrieren: bessere personalisierte Medizinlösungen für seine Kunden zu entwickeln.

* Health Insurance Portability and Accountability Act